Ce qu'est la méthylation
La méthylation consiste à ajouter une petite unité chimique, un groupe méthyle (un carbone et trois hydrogènes), à une autre molécule. Votre corps le fait en permanence : pour fabriquer la créatine et la phosphatidylcholine, pour dégrader neurotransmetteurs et hormones, pour activer ou atténuer des gènes, et pour recycler un acide aminé, l'homocystéine, en méthionine. Le donneur universel de méthyle est une molécule appelée SAMe, que vos cellules reconstituent grâce à deux boucles liées, le cycle des folates et le cycle de la méthionine. Ces boucles fonctionnent grâce à quelques nutriments : folate (vitamine B9), vitamine B12, vitamine B6, riboflavine (B2), choline et bétaïne.
Une précision de vocabulaire. La méthylation dont il est question ici est un ensemble de réactions chimiques de traitement des nutriments. Elle n'a rien à voir avec l'« âge de méthylation de l'ADN » d'un test d'horloge épigénétique, et les variants d'une puce ADN grand public ne la mesurent pas.
Les gènes impliqués
Les gènes donnent les instructions des enzymes et des transporteurs de ces boucles. Leurs variants courants peuvent rendre une enzyme un peu plus rapide ou plus lente, ou modifier vos besoins en un nutriment. Voici les gènes que nous lisons dans nos rapports, en deux groupes. Chacun renvoie vers sa fiche.
Groupe 1 : la mécanique des folates et de la B12
| Gène | Variants lus | Rôle |
|---|---|---|
| MTHFR | rs1801133, rs1801131, rs2274976 | Fabrique la forme active du folate qui alimente le recyclage de l'homocystéine |
| MTR | rs1805087 | Retransforme l'homocystéine en méthionine, avec la vitamine B12 |
| MTRR | rs1801394 | Maintient sous forme active la B12 utilisée par MTR |
| SHMT1 | rs1979277 | Fournit au cycle des folates des unités à un carbone issues de la sérine |
| SLC19A1 | rs1051266 | Aide à faire entrer le folate dans les cellules |
| TCN2 | rs1801198 | Transporte la vitamine B12 dans le sang jusqu'à vos cellules |
| FUT2 | rs601338, rs602662 | Associé à des différences de vitamine B12 circulante et de bactéries intestinales |
Groupe 2 : donneurs et consommateurs de méthyle
| Gène | Variants lus | Rôle |
|---|---|---|
| BHMT | rs3733890 | Seconde voie de recyclage de l'homocystéine, avec la bétaïne issue de la choline et d'aliments comme la betterave |
| PEMT | rs12325817 | Fabrique de la choline dans l'organisme ; associé dans des études au besoin en choline alimentaire |
| CBS | rs234706 | Fait poursuivre l'homocystéine vers la cystéine, avec la vitamine B6 |
| COMT | rs4680, rs4633 | Dégrade dopamine, adrénaline et œstrogènes à l'aide d'un groupe méthyle |
MTHFR : le plus célèbre, remis en proportion
MTHFR concentre l'attention. Son variant le plus connu, C677T (rs1801133), rend l'enzyme moins stable à la chaleur et moins active. Dans les études de laboratoire, les personnes qui en portent deux copies (génotype « TT ») gardent environ 30 % de l'activité normale, et celles qui en portent une copie environ 65 %. Le génotype TT est courant : environ un Européen sur dix, davantage dans certaines populations hispaniques. Ce n'est donc pas un défaut rare.
Le contexte compte. L'effet sur l'homocystéine apparaît surtout quand l'apport en folates est faible ; avec une alimentation riche en folates, la différence est bien plus petite. Et la valeur clinique du test est limitée : depuis 2013, l'American College of Medical Genetics and Genomics déconseille le dépistage systématique de MTHFR C677T et A1298C dans le bilan des thromboses ou des fausses couches à répétition. Notre article sur MTHFR va plus loin.
Ce que votre ADN ne peut pas dire
- Votre statut réel. Un génotype dit comment une enzyme est construite, pas combien de folate, de B12 ou d'homocystéine circule dans votre sang aujourd'hui. Cela dépend de l'alimentation, de l'alcool, des médicaments, de la santé intestinale, de l'âge et d'autres facteurs.
- Si vous avez besoin d'un complément. Les preuves qu'un choix de méthylfolate plutôt que d'acide folique ordinaire, fondé sur un résultat MTHFR, améliore les résultats sont limitées. Plus n'est pas mieux non plus : à long terme, de fortes doses de vitamine B6 peuvent par exemple abîmer les nerfs. Les décisions sur les compléments relèvent d'un médecin ou d'un diététicien qui voit vos analyses.
- Que faire baisser l'homocystéine protégera votre cœur. Une homocystéine élevée est associée à un risque cardiovasculaire et cognitif, mais de grands essais de vitamines B qui la faisaient baisser n'ont pas clairement réduit les infarctus ni les AVC.
- Le tableau complet. Ces gènes côtoient des dizaines d'autres, et un variant isolé ne déplace généralement les probabilités que très légèrement.
L'alimentation d'abord : les nutriments de la méthylation
Les mêmes aliments soutiennent cette voie quel que soit votre génotype. Un variant peut rendre plus utile d'en manger régulièrement, mais change rarement lesquels.
| Nutriment | Rôle | Sources alimentaires |
|---|---|---|
| Folate (B9) | Transporte les unités à un carbone | Légumes verts à feuilles, légumineuses, agrumes, avocat, céréales enrichies |
| Vitamine B12 | Nécessaire à MTR pour recycler l'homocystéine | Poisson, viande, œufs, produits laitiers. Les personnes végétaliennes ont besoin d'une source fiable (aliments enrichis ou complément), quels que soient leurs gènes. |
| Vitamine B6 | Nécessaire à CBS | Volaille, poisson, pommes de terre, pois chiches, bananes |
| Riboflavine (B2) | Cofacteur de l'enzyme MTHFR | Produits laitiers, œufs, amandes, champignons |
| Choline | Alimente la voie de la bétaïne | Œufs, soja, poisson, foie, crucifères |
| Bétaïne | Donneur de méthyle pour BHMT | Betterave, épinards, quinoa, blé complet |
Une consommation d'alcool importante est la cause classique d'épuisement des folates et de la B12, et certains médicaments courants les affectent aussi : parlez de votre alimentation et de votre consommation à votre médecin si une prise de sang est anormale.
Comment vérifier que tout fonctionne
Pour savoir où en sont vos nutriments liés à la méthylation, demandez à un médecin des analyses de sang : vitamine B12, folates et homocystéine sont les examens habituels. Ils mesurent votre statut actuel, ce qui compte vraiment, et peuvent être refaits après un changement d'alimentation. Un résultat ADN peut ensuite aider à expliquer une situation. Il ne devrait pas être le point de départ d'un traitement.
Dans le rapport Complet et le rapport Ultimate, ces gènes figurent dans la voie de la méthylation avec des conseils alimentaires. Vous pouvez envoyer le fichier brut de n'importe quel grand fournisseur ; voyez comment obtenir votre fichier ADN brut.